Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbp4A4UUI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms