Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ism1A2ATD1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms