Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhox3fA2ANE1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms