Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Camsap1A2AHC3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Camsap1A2AHC3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms