Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramel3A2AHA7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramel3A2AHA7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms