Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms