Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc163A2AGD7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc163A2AGD7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms