Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ttc39aA2ACP1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ttc39aA2ACP1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms