Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pramef6A2A8M8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms