Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms