Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Lrit3W8DXL4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Lrit3W8DXL4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms