Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vstm4T1NXB5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms