Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt27Q9Z320 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt27Q9Z320 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt27Q9Z320 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt27Q9Z320 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms