Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdac5Q9Z2V6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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