Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac6Q9Z2V5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Hdac6Q9Z2V5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Hdac6Q9Z2V5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
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Hdac6Q9Z2V5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hdac6Q9Z2V5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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