Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl40Q9Z2Q5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms