Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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