Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tulp1Q9Z273 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms