Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trip6Q9Z1Y4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip6Q9Z1Y4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms