Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ilf3Q9Z1X4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ilf3Q9Z1X4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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