Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Thbs4Q9Z1T2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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