Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lgr5Q9Z1P4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms