Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn13Q9Z0S4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cldn13Q9Z0S4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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