Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme3Q9WV85 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms