Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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VapaQ9WV55 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VapaQ9WV55 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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VapaQ9WV55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VapaQ9WV55 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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