Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnip1Q9WUU8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms