Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slit2Q9R1B9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms