Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trex2Q9R1A9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms