Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms