Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Wdr54Q9R0D8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Wdr54Q9R0D8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms