Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp11cQ9QZW0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms