Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms