Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nphs1Q9QZS7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nphs1Q9QZS7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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