Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms