Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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Usp21Q9QZL6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Usp21Q9QZL6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp21Q9QZL6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp21Q9QZL6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms