Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ChmlQ9QZD5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ChmlQ9QZD5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ChmlQ9QZD5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms