Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubxn8Q9QZ49 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms