Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms