Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Exo1Q9QZ11 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms