Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms