Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Chaf1aQ9QWF0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Chaf1aQ9QWF0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms