Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csnk1eQ9JMK2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csnk1eQ9JMK2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms