Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Pole3Q9JKP7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pole3Q9JKP7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms