Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
AtrQ9JKK8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms