Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx6Q9JKK1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms