Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms