Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad9Q9JIW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smad9Q9JIW5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms