Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc12a4Q9JIS8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms