Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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