Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
OtofQ9ESF1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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